食品生产许可证应由县级以上地方人民政府食品药品监督管理部门向食品生产经营许可的机构依法发放。流程大概如下：1:首先明确自己想申请哪个单元，生产单元是根据《食品生产许可证审查总则》、《食品生产许可证审查细则》进行划分的，共有31大类，细分的单元就更多了。2：先进行厂房设计，各功能区要满足生产实际需求。洗手更衣间进生产区（准洁净区）、内包间（洁净区）的空气洁净度高于生产区、外包间属于普通区域、成品库也属于普通区域。3：内页材料的准备：包括食品生产许可证申请书（当时行政服务中心网站上进入食品生产许可证进行下载），厂房平面布局图、设备布局图、厂区环境图、相应的制度，包括两个方面：A安全管理制度，制度包括：质量方针、目标治理结构图及职能分配、管理职责、权利、义务、岗位职责、权利、义务等一系列材料。（一共有22项，就不一一列举了，行政服务中心的网站上有）B原辅料、包材、添加剂的相关资料，包括上家的营业执照、生产许可证、检验报告，发票，一品一码等。
4：自己产品的检验报告，一般到当地的产品质量检验所进行检验，拿到检验报告（需花钱）。5：厂区空气洁净度检验报，环境过程微生物监测报告（基本上也到当地产品质量检验所申请检验，需花钱）6：以上材料准备好后，把内页材料装订成册，到设区市（县）行政服务中心市场监管窗口提交申请，5-7个工作日会做出补正材料或者受理申请。补正的话就是内页材料有欠缺，你把申请书等材料拿回来进行补正修改，然后再申请。7：窗口受理后，窗口会把申请材料递交给当时的审评中心，审评中心拿到材料后会在10个工作日内安排到厂进行审查。8：审评中心现场审查的时候，会要求产品试制，查阅内页材料等。当天快结束时审查员会下结论，基本上评分要90以上并且没有不合格项，如果有不合格项就是现场审查未通过，你得重新进行以上流程。现场审查通过后，有整改项就整改，并等待窗口发证。9：证到手，就可以正式生产了，日常监管归当地所属市场监管所。